高本贯通最明显的弊端就是学制长、拿证所需的时间久。高本贯通学制是5年，只有完成5年所有的教学计划，达到院校设置的毕业标准，才可以毕业拿到学历。如果中途因为工作调动等原因不能按时完成教学计划的话，还会延长拿证的时间。因为5年的时间较长，存在太多的变数，所以许多人中途可能会被迫放弃学习。

　　此外，高本贯通还有个弊端就是专业选择性少。大多数高校开展的高起本招生都只有3、5个招生专业，有的更少，许多学校甚至是没有高本贯通的。

　　上海公布了首批专科高等职业教育-应用型本科教育人才贯通(“高本贯通”)培养试点。首批试点的是一所本科院校和两所高职院校，即上海应用技术大学、上海城建学院和上海电子信息职业技术学院。

　　具体方式为：上海城建学院的建筑工程技术专业学生3年高职学习后，将前往上海应用技术大学的土木工程专业进行2年的本科学习;上海电子信息职业技术学院的信息安全与管理专业学生3年高职学习后，将前往上海应用技术大学的计算机科学与技术专业进行2年的本科学习。

　　此次选择的专业主要考量为技术技能要求较高、培养周期较长、社会人才需求旺盛且稳定。试点专业纳入高职院校高考招生专业目录，通过秋季全国统一高考招生，招生计划由上海市教委统筹安排。

　　也就是说，这两所高职院校两个专业的学生，今后将获得直接进入本科院校学习并取得相关证书的“快速通道”。